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圣母大學(xué)化學(xué)與生物分子工程系開設(shè)有2種研究生學(xué)位項目，分別是：
化學(xué)工程碩士：為期16-24個月，共計30個學(xué)分，需要撰寫研究論文，要求申請者擁有本科化學(xué)工程專業(yè)背景。
化學(xué)工程碩博連讀項目：為期4-4.5年，要求申請者擁有與化學(xué)工程相關(guān)專業(yè)（包括化學(xué)、物理、數(shù)學(xué)、材料科學(xué)、其他工程學(xué)科等）的本科學(xué)位背景即可，碩士文憑不能直接申請博士項目。無化學(xué)工程專業(yè)背景者入學(xué)后仍需修一定的前置課程。該項目每年錄取人數(shù)約15-22人，其中，國際學(xué)生占比45%，所有學(xué)生均可獲得RA或?qū)W費減免獎學(xué)金。
| 排名 | 學(xué)校 | 專業(yè)（major） |
|---|---|---|
| 1 | 麻省理工學(xué)院 | 化學(xué)工程 |
| 2 | 清華大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 3 | 天津大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 4 | 佐治亞理工學(xué)院 | 化學(xué)工程 |
| 5 | 斯坦福大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 6 | 北京化工大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 7 | 浙江大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 8 | 華南理工大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 9 | 四川大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 10 | 加州大學(xué)伯克利分校 | 化學(xué)工程 |
| 11 | 華東理工大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 12 | 德克薩斯大學(xué)奧斯汀分校 | 化學(xué)工程 |
| 13 | 新加坡國立大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 14 | 大連理工大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 15 | 科羅拉多大學(xué)波德分校 | 化學(xué)工程 |
| 16 | 中國科學(xué)技術(shù)大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 17 | 加州理工學(xué)院 | 化學(xué)工程 |
| 18 | 蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院 | 化學(xué)工程 |
| 19 | 南洋理工大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 20 | 上海交通大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 21 | 西安交通大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 22 | 南京工業(yè)大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 23 | 中國石油大學(xué)（北京） | 化學(xué)工程 |
| 24 | 華中科技大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 25 | 帝國理工學(xué)院 | 化學(xué)工程 |
| 26 | 普林斯頓大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 27 | 哈爾濱工業(yè)大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 28 | 中南大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 29 | 湖南大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 30 | 江蘇大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 31 | 北卡羅來納州立大學(xué)羅利分校 | 化學(xué)工程 |
| 32 | 賓夕法尼亞州立大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 33 | 武漢理工大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 34 | 阿卜杜拉國王科技大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 35 | 重慶大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 35 | 蘇州大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 37 | 南京大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 38 | 特拉華大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 39 | 洛桑聯(lián)邦理工學(xué)院 | 化學(xué)工程 |
| 40 | 中國石油大學(xué)（華東） | 化學(xué)工程 |
| 41 | 福州大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 42 | 加州大學(xué)圣塔芭芭拉分校 | 化學(xué)工程 |
| 42 | 明尼蘇達大學(xué)雙城分校 | 化學(xué)工程 |
| 44 | 鄭州大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 45 | 浙江工業(yè)大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 46 | 康奈爾大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 47 | 丹麥技術(shù)大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 48 | 莫納什大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 49 | 中山大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 50 | 東南大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 51 | 北京理工大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 51 | 香港城市大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 51 | 廣東工業(yè)大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 51 | 阿卜杜勒阿齊茲國王大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 51 | 魯汶大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 51 | 南開大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 51 | 西北大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 51 | 萊斯大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 51 | 山東大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 51 | 山東科技大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 51 | 深圳大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 51 | 南方科技大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 51 | 太原理工大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 51 | 德州農(nóng)工大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 51 | 香港理工大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 51 | 香港科技大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 51 | 新南威爾士大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 51 | 昆士蘭大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 51 | 同濟大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 51 | 劍橋大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 51 | 芝加哥大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 51 | 圣母大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 51 | 牛津大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 51 | 武漢大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 51 | 廈門大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 76 | 卡內(nèi)基梅隆大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 76 | 中國礦業(yè)大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 76 | 科庭大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 76 | 代爾夫特理工大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 76 | 東華大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 76 | 復(fù)旦大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 76 | 漢陽大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 76 | 高麗大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 76 | 南京理工大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 76 | 華北電力大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 76 | 挪威科學(xué)技術(shù)大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 76 | 北京大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 76 | 青島科技大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 76 | 亞琛工業(yè)大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 76 | 首爾國立大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 76 | 香港中文大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 76 | 曼徹斯特大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 76 | 蔚山國立科技研究所 | 化學(xué)工程 |
| 76 | 阿爾伯塔大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 76 | 電子科技大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 76 | 密歇根大學(xué)安娜堡分校 | 化學(xué)工程 |
| 76 | 北京科技大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 76 | 田納西大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 76 | 滑鐵盧大學(xué) | 化學(xué)工程 |
| 76 | 威斯康星大學(xué)麥迪遜分校 | 化學(xué)工程 |
